Odkrycie nowej rodziny prawdopodobnych oksydoreduktaz związanych z rozwojem nowotworów

Mimo tego, że dziesięć lat temu poznaliśmy sekwencję genomu człowieka, nadal znacząca część ludzkiego proteomu (przynajmniej jedna czwarta wszystkich białek) ma całkowicie nieznaną funkcję molekularną. Białka takie, nawet jeśli mają poszlakowe związki z chorobami ludzkimi, nie mogą być wykorzystywane przy formułowaniu nowych hipotez terapeutycznych. Z kolei, jeśli brak nawet hipotez dotyczących funkcji molekularnej danego genu i białka, rzadko staje się ono obiektem szczegółowych badań.

W naszej pracy zajmujemy się białkami z rodziny nazwanej przez nas P-DUDES, o nieznanej dotąd funkcji molekularnej. Wiele publikacji wskazywało na związki białek tej rodziny z poważnymi chorobami ludzkimi (nowotwory płuc, przewodu pokarmowego, białaczki, zaburzenia rozwojowe układu nerwowego i in.).

Stosując bioinformatyczne metody przewidywania struktury białka przez poszukiwanie bardzo odległych podobieństw sekwencji, pokazaliśmy, iż białka P-DUDES zawierają domeny o strukturze podobnej do oksydoreduktaz z nadrodziny tioredoksyn. Dalsze analizy pozwoliły sformułować hipotezę, że funkcja tej domeny to peroksyredoksyna, enzym z rolą w obronie przed stresem oksydacyjnym oraz w sygnalizacji wewnątrzkomórkowej.
Następnie, analizując dane ekspresji genów dostępne w bazach danych, wykazaliśmy nieopisany dotąd związek genów P-DUDES z rozwojem nowotworu tkanki glejowej mózgu – glejaka. Ponadto odkryliśmy intrygujący profil filogenetyczny genów P-DUDES: występują one jedynie u kręgowców oraz kilku odległych od siebie grup bakterii, w większości wodnych.
Dzięki opisanemu tu odkryciu białka P-DUDES mogą w przyszłości okazać się obiecującymi białkami docelowymi dla nowych leków (drug targets).

Data publikacji
2 marca 2011