Celem działalności Samorządu Doktorantów IBD jest reprezentowanie interesów doktorantów zarówno wewnątrz, jak i poza Instytutem. Bronimy przestrzegania praw doktorantów, jak również walczymy o nowe, które – naszym zdaniem – nam się należą. Dążymy także do integracji środowiska doktorantów poprzez włączanie się w inicjatywy popularnonaukowe, kulturalne czy sportowe.