Organelle wewnątrzkomórkowe dynamicznie komunikują się,ze sobą,  tworząc miejsca bliskiego kontaktu,nie dochodzi jednak do fuzji błon. Powstają natomiast miejsca kontaktu (mikrodomeny), które umożliwiają szybkie komunikowanie się organelli komórkowych. Mikrodomeny błon oddziałujących z błoną plazmatyczną (PAMs), zawierają obok elementów błony plazmatycznej (PM) także elementy błony siateczki endoplazmatycznej (ER) i mitochondriów. PAMs, umożliwiają transport białek, lipidów, jonów oraz metabolitów pomiędzy PM, ER i mitochondriami. W naszej pracy przedstawiliśmy zoptymalizowany protokół izolowania PAMs, PM oraz ER, z wykorzystaniem sekwencji wirowań, po których dokonano frakcjonowania błony plazmatycznej stosując skokowy gradient sacharozy. Procedura może być z powodzeniem zmodyfikowana i zaadoptowana do szeregu tkanek i komórek.